Books (本 ・ 解説)
著書
- 金子邦彦、澤井哲、高木拓明、古澤力. (2020) 細胞の理論生物学、東京大学出版会、345ページ
- 普遍生物学：物理に宿る生命、生命の紡ぐ物理(東大出版会)305ページ、2019年１０月(3600円)
- 金子 邦彦. 「複雑系生物学―ゆらぎ、安定性、可塑性と適応、進化、発生」. （浅島誠 他, 「現代生物化学入門８：システムバイオロジー」, 75-113, 岩波書店, 2010)
- 生命とは何か（第２版）-- 複雑系生命科学へ--、東大出版会、442ページ、2009年２月(3600円)
(生命とは何かー複雑系生命論序説（2003年）の改訂増補版：遺伝、代謝、分化、発生、進化の普遍的特性をを、構成的生物学実験および複雑系理論から捉える)
- 複雑系のバイオフイジックス (共立出版、シリーズニューバイオフイジックス７)、
2001(金子邦彦編： (第１章金子、第２章 澤井ー沢田、第３章 古澤(当研究室2000年卒業の博士論文に基づく)、
第４章 柏木ー四方、第５章上田、第６章 構成的生物学に関する四方ー伏見対談、
第７章 大沢文夫による自発性についての解説
- 複雑系の進化的シナリオ −生命の発展様式− (朝倉書店)、
１９９８ 金子邦彦、池上高志
- 複雑系のカオス的シナリオ (朝倉書店)、 1996
金子邦彦、津田一郎
- Life: An Introduction to Complex Systems Biology, Springer 2006（上記「生命とは何か」の初版本を加筆改稿、第2版本の結果も一部述べる）
- Complex Systems: Chaos and Beyond, Springer 2001 ( K. Kaneko and I. Tsuda, 上記「複雑系のカオス的シナリオ」に基づく)
- Theory and Applications of Coupled Map Lattices (Wiley) 1993: edition and Chapter 1
- Collapse of Tori and Genesis of Chaos in Dissipative Systems (World Sci. Pub., 1986, 264
pages : based on thesis of 1983)
Edition of special issue (特集号の編集および執筆)
- K.Kaneko and T. Tsuda, ``Special issue on Chaotic Itinerancy", Chaos 13 (2003)
- K. Kaneko , T. Ikegami, and I. Tsuda, ``Constructive Complexity and Artificial
Reality", Special issue of Physica D (75;1994)
- K. Kaneko, ``Special issue on Coupled Map Lattice" Chaos 2 (1992)
- 特集 「複雑系-生成と崩壊のダイナミクス」 編集 (数理科学 ３９６号 １９９６年)
- 特集 「複雑系の科学」 編集 (数理科学 ３３６号 １９９１年)
雑誌や本の中での日本語解説
- 金子 邦彦. 「普遍生物学」. 数理科学11月号 (2021) 51-57
- 山岸純平、斉藤稔、金子邦彦. 「代謝漏出による微生物の共存共栄戦略」. 生物物理 61(2021) 400-403
- 金子邦彦. 「表現型の揺らぎと進化の方向性」. 生物の科学 遺伝 2022年1月号(vol.76) 60-65
- 金子 邦彦. 「日本進化学会学会賞・木村資生記念学術賞を受賞して」. 進化学会ニュースレター3月号（2021）
- 金子 邦彦. 「普遍生物学：小松さんへのレポート」. 現代思想（10月号、総特集、小松左京） pp218-226（2021）
- 金子 邦彦. 「科学にとって私とは 個人性と普遍性の奇妙な両立」. 現代化学(2020年8月号）
- 畠山哲央、金子邦彦、「生体リズムの頑健性と可塑性」、生物物理 57（4），186-190（2017）
- 金子邦彦、「可塑性、頑強性、活動性の普遍生物学」、生体の科学 65(2014) 438
- 金子邦彦, 自己言及的伏線遍歴（"物理の道しるべ" 19回）（数理科学, 569, 78-83）(pdf file )
- 藤本 仰一, 石原 秀至, 金子 邦彦. 「空間パタン形成の遺伝子ネットワーク進化理論―ネットワーク構造と機能の対応づけ」. （生物物理, Vol.50, No. 1, 018-022
） 2010.(pdf file )
- 金子邦彦. 「生命とは何か 1944(1948) vs 2003(2009)」. （数理科学：特集シュレーディンガー, 555, 45-50,） 2009.(pdf file )
- 金子邦彦「細胞状態の動態、ゆらぎと適応、分化」 パリティ vol.24 No.01, pp72-74 2009年1月号 丸善
- 金子邦彦「細胞分化の不可逆性とその巻き戻し」 現代思想「万能細胞――人は再生できるか」 vol.36-8, pp82-93 2008年7月号 (pdf file )
- 金子邦彦, 吉田寛, 古澤力「多細胞生物の再帰的増殖と細胞タイプ多様性の両立条件」 生物物理 vol.47 No.01, pp29-35 2007
- 金子邦彦. 生命システムをどう理解するか：可塑性，揺らぎ，進化（浅島誠編集）96-115. 共立出版. 2007
- 金子邦彦．物理学で生命システムを理解する．学問の扉：東京大学は挑戦する．（東京大学）．190-200．講談社（東京）．2007.
- 金子邦彦, 古澤力. 複製細胞の反応ネットワークダイナミクス. （数理科学, 529, 77-83,） 2007.
- 津田一郎、金子邦彦「複雑系」（岩波数学辞典の項目）、2007
- 金子邦彦、安冨歩「経済学から歴史学中心の社会科学へ」（経済学の現在２、２００５年）
- 古澤力、金子邦彦「複雑系としての生命システムの論理：細胞状態の普遍統計則を中心にして」 細胞工学 ２００４年 vol.23 No.4
- 「生命システムの論理」 (「２１世紀物理学はどう変わるか」、掌華房、2002)
- 「複雑系としての生命科学」 (「複雑システム科学」放送大学大学院教材 NHK協会、2002)
- 「共依存的生滅の論理」(with 安富歩) (「社会経済史学の課題と展望」、有斐閣、2001)
- 「複雑系としての生命システムの論理を求めて」 物理学会誌 ５５ (２０００)５０８ー５１８ (pdf file )
- 複雑系生命科学の問題 数理科学 ４４１ ２０００年 ２８ー３６
- 金子邦彦 「複雑系生命科学の構築にむけて I、II、III」、 パリティ ２０００年
- 「動的相互作用生命観」 講座「生命」(哲学書房、１９９７)
- 「多重アトラクター系の解剖に向けて」数理科学１９９７年６月号
- 複雑系ーカオス的シナリオから生命的シナリオへ 現代思想
１９９６年１１月号
- 「相互内部ダイナミクス系としての生命観」 現代思想
１９９５年１２月号
- 「カオスネットワークと階層的ダイナミクス」 日本物理学会誌
１９９５年５０ 号２８９ー２９５ (pdf file )
- 「多様性をうみだすカオス」 日経サイエンス １９９４年 ５月号
34-41(別冊「複雑系が開く世界」(1997)に所収) (pdf file )
- 「カオスによる複雑さと多様性の創発と進化」 電子通信学会誌
１９９４年 ７７号 128-134
- 「カオス、CML、複雑系」 科学 １９９２年 ６２号 ４２７ー４３５
- 「Coupled Map Lattice とその応用」 海洋 １９９１年 ２３号
６０６ー６１１
- 「大自由度カオス」 (数理科学３３６号 １９９１年６月号)
１６ー２１
- 「時空カオス」 日本物理学会誌 １９８８ 年 ４３号
６８９ー６９７ ( Assoc. Asian Pacific Physical Societies Bulletin 1 No.3 12-20 に
英訳が掲載
書評ほか
- 「数学はこうしてつくられていく」：津田一郎著「脳の中に数学をみる」の書評、数学セミナー、2017年２月号
- 書評：大沢流手作り統計力学、 生物物理学会誌 （2013）vol.53 No.6, 340
- 歴史の小径： 久保亮五先生「基礎と応用」、日本物理学会誌、（2011） vol.66 No.2
本(非学術書)
- カオスの紡ぐ夢の中で( エッセイ・小説集) 小学館文庫１９９７, （早川書房より再刊, 2010）
エッセイ、書評、解説等（非学術的なもの）（最近のもの：それ以外はほぼ上掲書に掲載）
- 読者を書きかえ続ける世界文学（書評「道化師の蝶」）（2012年、群像、５月号）
- 内部の師との出会いと永訣（追悼、小松左京） （2011年、文学界 10月号、202−205）
- 紀元前４８０年のTwitter 金子邦彦 （2010年、本の雑誌、９月号）
- 解説：猿の証言（北川歩実、新潮文庫 2000年）
- 解説：継ぐのは誰か（小松左京、ハルキ文庫1998年）